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Bioinformática Integrativa

Bioinformática integrativa

Responsable: Dr. Francisco Joel Jahuey Martínez


En ciencias ómicas, el uso de tecnologías de alto rendimiento (p. e. de secuenciación, genotipificación, etc.) produce grandes cantidades de información biológica que generalmente es depositada en bases de datos (big data). El análisis de estas grandes bases de datos requiere del uso de herramientas bioinformáticas que permitan descifrar e inferir nuevos conocimientos. Actualmente, en esta línea de investigación se están realizando proyectos para explorar bases de datos biológicas relacionadas con especies ganaderas. Uno de ellos consiste en analizar la AnimalQTLdb, la cual es una base de datos que contiene las posiciones del ADN que han sido asociadas a características de importancia en ganado. El objetivo de esta aproximación es identificar las regiones más importantes del genoma de dichas especies para realizar estudios de validación que permitan detectar marcadores para la selección animal. Una segunda etapa, involucrará la integración de otras bases de datos, tanto de expresión (Gene Expression Omnibus), interacción (STRING) y de anotación (Gene Ontology) para inferir relaciones entre genes y entre fenotipos y así poder detectar genes con efecto en múltiples características. También se utilizará la información biológica disponible de genes importantes para evaluar el impacto de estos a nivel de sistemas con el objetivo de identificar genes de efecto mayor. Esta línea de investigación también contempla el desarrollo de software que facilite la ejecución de procedimientos y análisis bioinformáticos relacionados.

Fecha de publicación: 2019-03-13 14:59:35
URL de este artículo: /noticias/bioinformarica_integrativa/
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